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    揭露重庆时时彩骗局: 一种基于功能??榈纳锓肿油绶治龅姆椒?pdf

    摘要
    申请专利号:

    重庆时时彩单双窍门 www.4mum.com.cn CN201410042705.X

    申请日:

    2014.01.29

    公开号:

    CN103778349A

    公开日:

    2014.05.07

    当前法律状态:

    授权

    有效性:

    有权

    法律详情: 授权|||实质审查的生效IPC(主分类):G06F 19/12申请日:20140129|||公开
    IPC分类号: G06F19/12(2011.01)I 主分类号: G06F19/12
    申请人: 思博奥科生物信息科技(北京)有限公司
    发明人: 不公告发明人
    地址: 100070 北京市丰台区丰台科学城航丰路8号1幢楼1808室
    优先权:
    专利代理机构: 代理人:
    PDF完整版下载: PDF下载
    法律状态
    申请(专利)号:

    CN201410042705.X

    授权公告号:

    ||||||

    法律状态公告日:

    2017.02.15|||2014.06.11|||2014.05.07

    法律状态类型:

    授权|||实质审查的生效|||公开

    摘要

    本发明属于生物信息技术领域。本发明提供了一种基于功能??榈纳锓肿油缛缁虮泶锏骺赝缁虻鞍字氏嗷プ饔玫韧缂浔冉系姆椒?,主要包括如下步骤:构建生物网络的邻接矩阵Madj,计算网络节点间的功能相似性矩阵Msim,计算网络边的功能权重矩阵,最小图熵算法挖掘网络???,最后对网络??榻泄δ芨患治?,其中符号含义如说明书中所定义。

    权利要求书

    权利要求书
    1.   一种基于功能??榈纳锿绶治龇椒?,通过网络中节点间的功能相似性结合网络的拓扑性质,筛选出网络中功能关联的一些节点和边,组成功能???。

    2.   权利要求1的方法,对于给定的生物网络G (V,E),V网络中的节点集合,E网络中边的集合,该方法包含如下步骤:
    步骤1,基于所述生物网络G,构建网络节点间的邻接矩阵Madj,矩阵的行和列分别表示网络中的节点集合V,矩阵由0和1构成,如果两个节点间存在边关系,则矩阵中此两个节点所在行和列相交的元素为1,其他情况则为0;
    步骤2,构建网络节点间的邻接矩阵Msim,矩阵的行和列分别表示网络中的节点集合V,矩阵由0.001-1的小数构成,如果两个节点间存在语义相似性,则矩阵中此两个节点所在行和列相交的元素为这两个节点的功能语义相似性得分,如果两个分子节点间存在完全语义相似性则为1,如果两个分子节点间不存在语义相似性则为0.001;
    步骤3,计算网络边的功能权重矩阵ME,                                               ;
    步骤4,基于最小图熵算法挖掘网络的子??椋菏紫妊《ㄖ肿咏诘悖ㄓ叛《炔恍∮?的节点)及其邻居节点作为种子簇,然后逐个地删除种子簇中种子节点的邻居节点,尽可能地减小簇的图熵;接下来,再将种子簇的邻居节点中可以降低簇的图熵的节点添加进来,重复这个过程,直到图熵无法进一步降低,当图熵小于预设经验阈值(例如20)时循环停止。

    3.   权利要求1的方法,还包括步骤5,对步骤4识别出的功能??榻泄δ芨患治觯ɡ缭谙吖δ芨患治龉ぞ逥AVID或Perl平台的GO::TermFinder工具)。

    4.   权利要求1-3任一项的方法,所述生物网络包含基因转录调控网络、蛋白质相互作用网络、代谢网络和非编码基因调控网络及其跨组学调控网络等。

    5.   权利要求2或3的方法,所述功能语义相似性得分计算基于基因本体Gene Ontology的分子功能语义,或者基于生物学过程和细胞学组成语义,例如通过功能语义相似性算法GOSemSim(Yu G,Bioinformatics 2010)进行计算。

    6.   权利要求2或3的方法,所述最小图熵算法为:图熵,Ω表示子??槟诘亩サ慵?,i属于Ω,,ni为节点与??槟诘牧诮咏诘慵涔δ苋ㄖ乩奂雍?,Ni为节点在大网络中与其邻接节点间功能权重累加和,。

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    一种 基于 功能???生物 分子 网络分析 方法
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