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    碱基 序列 系统 方法
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    摘要
    申请专利号:

    CN201310064514.9

    申请日:

    2013.02.28

    公开号:

    CN103793625A

    公开日:

    2014.05.14

    当前法律状态:

    撤回

    有效性:

    无权

    法律详情: 发明专利申请公布后的视为撤回IPC(主分类):G06F 19/22申请公布日:20140514|||实质审查的生效IPC(主分类):G06F 19/22申请日:20130228|||公开
    IPC分类号: G06F19/22(2011.01)I 主分类号: G06F19/22
    申请人: 三星SDS株式会社; 延世大学校产学协力团
    发明人: 朴旻胥; 朴商贤; 吕润九
    地址: 韩国首尔市
    优先权: 2012.10.29 KR 10-2012-0120649
    专利代理机构: 北京铭硕知识产权代理有限公司 11286 代理人: 韩明星;李云霞
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    法律状态
    申请(专利)号:

    CN201310064514.9

    授权公告号:

    ||||||

    法律状态公告日:

    2017.03.29|||2014.06.11|||2014.05.14

    法律状态类型:

    发明专利申请公布后的视为撤回|||实质审查的生效|||公开

    摘要

    本发明公开一种碱基序列比对系统及方法。本发明一实施例提供的碱基序列比对系统包括:片段序列生成单元,从短片段序列生成多个片段序列;过滤单元,从所生成的多个片段序列构成候补片段序列集合;片段序列扩张单元,计算各个候补片段序列的在对象序列的映射位置的数量,选择所计算的映射位置的数量超过设定的值的片段序列,并对所选择的片段序列的大小进行扩张,直至在对象序列的映射位置的数量变成设定的值以下为止;映射长度计算单元,将对象序列分割为多个区间,并按照各区间分别计算候补片段序列的总映射长度;比对单元,选择所计算的总映射长度为基准值以上的区间,并对所选择的区间执行针对短片段序列的全局比对。

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